Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd4P10628 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms