Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01641 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01641 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01641 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01641 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01641 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
P01641 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01641 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
P01641 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
P01641 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01641 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01641 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01641 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01641 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01641 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms