Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BlmO88700 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BlmO88700 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BlmO88700 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BlmO88700 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BlmO88700 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BlmO88700 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BlmO88700 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BlmO88700 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BlmO88700 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BlmO88700 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BlmO88700 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BlmO88700 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BlmO88700 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BlmO88700 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BlmO88700 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BlmO88700 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BlmO88700 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BlmO88700 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BlmO88700 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BlmO88700 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BlmO88700 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BlmO88700 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BlmO88700 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BlmO88700 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BlmO88700 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BlmO88700 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BlmO88700 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BlmO88700 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BlmO88700 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BlmO88700 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BlmO88700 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BlmO88700 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
BlmO88700 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
BlmO88700 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BlmO88700 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BlmO88700 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BlmO88700 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BlmO88700 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms