Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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FxnO35943 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FxnO35943 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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FxnO35943 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
FxnO35943 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
FxnO35943 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FxnO35943 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FxnO35943 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FxnO35943 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FxnO35943 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FxnO35943 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FxnO35943 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FxnO35943 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FxnO35943 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FxnO35943 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FxnO35943 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FxnO35943 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FxnO35943 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FxnO35943 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FxnO35943 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FxnO35943 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FxnO35943 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FxnO35943 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FxnO35943 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FxnO35943 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FxnO35943 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FxnO35943 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FxnO35943 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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