Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc27a2O35488 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc27a2O35488 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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