Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nccrp1G3X9C2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nccrp1G3X9C2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms