Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm28038F7BCN9 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm28038F7BCN9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm28038F7BCN9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm28038F7BCN9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm28038F7BCN9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm28038F7BCN9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Gm28038F7BCN9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28038F7BCN9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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