Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Apol11b-204ENSMUST00000181467 1933 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Olfr1395-203ENSMUST00000214195 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Strip2-202ENSMUST00000115224 3524 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Lrit2-201ENSMUST00000057176 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm16287-201ENSMUST00000097827 2324 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Arhgap19-201ENSMUST00000026150 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Myo6-212ENSMUST00000184480 4139 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Nfat5-214ENSMUST00000169453 13380 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Gm20538F6Z9R1 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms