Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm5861F6VCN9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms