Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Syngap1F6SEU4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms