Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf169E9Q7F2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf169E9Q7F2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf169E9Q7F2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf169E9Q7F2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf169E9Q7F2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf169E9Q7F2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf169E9Q7F2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf169E9Q7F2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf169E9Q7F2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf169E9Q7F2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf169E9Q7F2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf169E9Q7F2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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