Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ccdc71lE9Q4T4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ccdc71lE9Q4T4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms