Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyp26c1B2RXA7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp26c1B2RXA7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms