Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn2B2RVW2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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