Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpb1B2RS76 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpb1B2RS76 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms