Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem235B1AQL3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem235B1AQL3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem235B1AQL3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem235B1AQL3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem235B1AQL3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem235B1AQL3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem235B1AQL3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem235B1AQL3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem235B1AQL3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem235B1AQL3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem235B1AQL3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem235B1AQL3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem235B1AQL3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem235B1AQL3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem235B1AQL3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmem235B1AQL3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms