Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rtf1A2AQ19 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rtf1A2AQ19 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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