Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ambra1A2AH22 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms