Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vstm4T1NXB5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms