Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgr5Q9Z1P4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms