Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sumo3Q9Z172 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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Sumo3Q9Z172 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Sumo3Q9Z172 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Sumo3Q9Z172 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Sumo3Q9Z172 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Sumo3Q9Z172 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Sumo3Q9Z172 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sumo3Q9Z172 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms