Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Six6Q9QZ28 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Six6Q9QZ28 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms