Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rb1cc1Q9ESK9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms