Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa8Q9DCJ5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms