Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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MNCb-2875Q9DCB3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MNCb-2875Q9DCB3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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