Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ccdc89Q9DA73 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ccdc89Q9DA73 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ccdc89Q9DA73 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Ccdc89Q9DA73 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ccdc89Q9DA73 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc89Q9DA73 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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