Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gcc1Q9D4H2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gcc1Q9D4H2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms