Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms