Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gtf2e1Q9D0D5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms