Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Elp3Q9CZX0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Elp3Q9CZX0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms