Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf146Q9CZW6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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