Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gins3Q9CY94 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins3Q9CY94 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms