Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Xrcc3Q9CXE6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Xrcc3Q9CXE6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Xrcc3Q9CXE6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Xrcc3Q9CXE6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Xrcc3Q9CXE6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Xrcc3Q9CXE6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Xrcc3Q9CXE6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Xrcc3Q9CXE6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Xrcc3Q9CXE6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Xrcc3Q9CXE6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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