Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cxxc1Q9CWW7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms