Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Nicn1Q9CQM0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms