Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rdm1Q9CQK3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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