Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms