Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chchd1Q9CQA6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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