Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Mrpl3Q99N95 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl3Q99N95 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl3Q99N95 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl3Q99N95 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl3Q99N95 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl3Q99N95 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl3Q99N95 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl3Q99N95 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl3Q99N95 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl3Q99N95 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms