Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brms1Q99N20 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brms1Q99N20 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms