Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ms4a6cQ99N08 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6cQ99N08 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms