Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms