Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms