Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klc3Q91W40 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms