Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smg8Q8VE18 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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