Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39cQ8VE09 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39cQ8VE09 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39cQ8VE09 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39cQ8VE09 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39cQ8VE09 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc39cQ8VE09 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ttc39cQ8VE09 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms