Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttc8Q8VD72 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttc8Q8VD72 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms