Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn4Q8VCH8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms