Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I2

Cchcr1, Coiled-coil alpha-helical rod protein 1, mousemouse

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Length 770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cchcr1Q8K2I2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cchcr1Q8K2I2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cchcr1Q8K2I2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cchcr1Q8K2I2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cchcr1Q8K2I2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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