Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Depp1Q8K2F3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms